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Die meiste Arbeit, die in einer lebenden Zelle erledigt wird, wird von ihren Proteinen erledigt. Eine Sache, die eine Zelle tun muss, ist, ihre DNA zu duplizieren.
In Ihrem Körper wurde beispielsweise die DNA milliardenfach dupliziert. Proteine erledigen diese Aufgabe, und eines dieser Proteine ist ein Enzym namens DNA-Ligase. Die Wissenschaftler erkannten, dass Ligase beim Aufbau von rekombinanter DNA im Labor nützlich sein könnte, und bauten daher einen Ligationsschritt in den Prozess der Herstellung rekombinanter DNA ein.
Die Struktur der DNA
Ein einzelner DNA-Strang besteht aus einer Sequenz stickstoffhaltiger Basen, die die Abkürzungen A, T, G und C tragen. Normalerweise befindet sich DNA in einem Doppelstrang, in dem eine lange Sequenz von Basen mit einem anderen, gleich langen Strang von übereinstimmt Basen.
Die beiden Stränge sind insofern komplementär, als wenn ein Strang ein A hat, der andere ein T hat und der eine ein G hat, der andere ein C. A und T stimmen über eine schwache chemische Bindung, die als Wasserstoffbindung bezeichnet wird, überein. und G und C machen dasselbe.
Insgesamt sind die beiden komplementären Stränge durch viele Wasserstoffbrücken miteinander verbunden. Jeder der beiden Einzelstränge hält seine eigenen Kernbasen zusammen mit einer stärkeren Bindung in Form einer langen Kette von kovalent verbundenen Zucker- und Phosphatgruppen.
Ligase-Funktion
Sie können sich einen DNA-Strang als ein langes Charm-Armband mit vier verschiedenen Arten von Charms vorstellen. Die Reize hängen einfach an der starken Kette, die sie miteinander verbindet.
Die DNA-Replikation bildet ein weiteres Charm-Armband, das auf das erste abgestimmt ist. Wo immer das erste Armband mit einem A-Anhänger versehen ist, passt ein T-Anhänger auf das zweite Armband, und das Gleiche gilt für C und G.
Die Charms des zweiten Armbands können mit denen des ersten Armbands übereinstimmen, ohne selbst an einem Armband zu sein. Das heißt, sie können sich über eine schwache Verbindung mit der gegenüberliegenden Kette verbinden, ohne eine starke Kette zu haben, um sie mit ihren Nachbarn zu verbinden.
Das DNA-Ligaseenzym erkennt Stellen, an denen die Zucker- und Phosphatkette unterbrochen ist, und baut die Verbindung wieder auf, wobei die Zucker- und Phosphatgruppen in einer starken Bindung verbunden werden.
Rekombinante DNA
Rekombinante DNA ist das Ergebnis des Schneidens eines Doppelstrangs von DNA und des Verbindens desselben mit einem anderen Doppelstrang. Jeder Doppelstrang ist oft ungleichmäßig geschnitten, wobei ein Strang einige Basen vor dem anderen endet.
An einem Ende hängen zusätzliche Sockel, wie z. B. bei TTAA. Der andere Doppelstrang hat zusätzliche Basen in einer Sequenz wie AATT. Die zwei Sätze zusätzlicher Basen - sogenannte "klebrige Enden" - greifen durch ihre schwachen Wasserstoffbrücken aneinander.
Wenn Sie wieder an Charm-Armbänder denken, stellen Sie sich vor, Sie haben ein doppeltes Charm-Armband mit zwei Ketten, die nur durch ihre Charms verbunden sind. Du schneidest das Ende ab, aber du schneidest ein Ende vier Zaubersprüche vor dem anderen, so dass ein kleiner Schwanz herunterhängt.
Sie machen dasselbe mit einem anderen doppelten Bettelarmband. Wenn sich die vier Reize ergänzen, verbinden sich die beiden ausgeschnittenen Reize, aber nur durch ihre Reize.
Bei der Rekombination verwendetes Ligaseenzym
Im vorherigen Schritt der DNA-Rekombination haben sich passende klebrige Enden zweier unterschiedlicher doppelsträngiger DNA-Moleküle verbunden. Die einzige Verbindung zwischen den beiden Abschnitten ist jedoch durch die schwachen Bindungen. Wie das Charm-Armband, das nur durch die passenden Charms verbunden ist, wäre es einfach, sie auseinander zu ziehen.
Das Enzym DNA-Ligase findet die Stellen, an denen die Zucker- und Phosphatgruppen nicht miteinander verbunden sind, und verbindet sie. Wie beim Charm Bracelet ist auch hier das neue, längere, doppelsträngige DNA-Molekül fest miteinander verbunden, nachdem die DNA-Ligase durchgelaufen ist und die Basen miteinander verkettet hat.