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Quantifizieren Sie Ihre RNA-Probe, indem Sie die Absorption von ultraviolettem Licht (UV) messen. Ein Nano-Drop-Spektrophotometer verwendet nur ein oder zwei Mikroliter Ihrer Probe, die Sie zurückgewinnen können. Andere Spektrophotometer erfordern eine viel größere Probe. Der Extinktionskoeffizient für Nukleotide bei einer UV-Wellenlänge von 260 nm in einem 1-cm-Lichtweg beträgt 20. Basierend auf diesem Extinktionskoeffizienten beträgt die Absorption von 40 ug / ml RNA unter den gleichen Bedingungen eins. Mit diesen Informationen können Sie die Konzentration Ihrer RNA-Probe berechnen.
Machen Sie gegebenenfalls eine Verdünnung Ihrer Probe. Eine Standardverdünnung für eine Mikroküvette beträgt 1:40. Nehmen Sie diese Verdünnung vor, indem Sie 2 µl RNA-Probe zu 78 µl sterilem Wasser geben.
Befolgen Sie die Protokolle Ihres jeweiligen Spektralphotometers, um das Gerät mit einem Blindwert zu kalibrieren, und bestimmen Sie dann die optische Dichte Ihrer Probe bei einer UV-Wellenlänge von 260 nm.
Multiplizieren Sie die Extinktion Ihrer Probe mit Ihrem Verdünnungsfaktor mit 40 μg RNA / ml. Die Gleichung lautet: "RNA-Konzentration (µg / ml) = (OD260) x (Verdünnungsfaktor) x (40 µg RNA / ml) / (1 OD260-Einheit)" (Hofstra.edu) Zum Beispiel: Wenn Sie Ihre Probe mit verdünnt haben 1:40 und Ihr Extinktionswert war 0,08, Sie würden 0,08 × 40 × 40 = 128 & mgr; g / ml = 0,13 & mgr; g / & mgr; l multiplizieren
Ermitteln Sie die Reinheit Ihrer Probe, indem Sie eine weitere Extinktionsmessung bei einer UV-Wellenlänge von 280 nm durchführen. Das Verhältnis OD 260 / OD 280 gibt an, ob und in welchem Ausmaß Ihre Probe mit Protein oder Phenol kontaminiert ist. Ein Ergebnis von 1,8 bis 2,0 zeigt eine hochwertige RNA an.