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New Zealands Ökosysteme sind nur geringfügig kleiner als der US-Bundesstaat Colorado und stehen vor zahlreichen ökologischen Herausforderungen, da das Land sowohl eine wirtschaftlich entwickelte Nation als auch eine Inselgemeinschaft ist. Während viele Industrieländer wie die Vereinigten Staaten ähnlichen Bedrohungen für das Ökosystem wie invasive Arten und industrielle Verschmutzung ausgesetzt sind, sind Inselstaaten wie Neuseeland einer erhöhten Bedrohung durch den Anstieg des globalen Meeresspiegels und dem Druck auf natürliche Ressourcen wie die Meeresfischerei ausgesetzt.
Invasive Arten
Die Einführung nicht heimischer Tiere und Pflanzen durch den Menschen in die neuseeländischen Ökosysteme hat die Gesundheit einheimischer Arten erheblich beeinträchtigt. Die Kiwi, ein flugunfähiger Vogel, der das Nationaltier des Landes ist, ist vom Aussterben bedroht, da 90 Prozent aller neuen Küken von invasiven Arten wie z. B. Wasserhähnen getötet werden, so das neuseeländische Naturschutzministerium. Invasive Pflanzen wie der Kletterspargel wirken sich auch auf die Waldökosysteme der Neuseeischen Inseln aus, indem sie sich im Unterholz ausbreiten und die Regeneration einheimischer Pflanzen verhindern.
Industrielle Verschmutzung
Schätzungsweise die Hälfte aller Seen in Neuseeland ist verschmutzt, die meisten Flüsse entsprechen nicht den Gesundheitsstandards für das Schwimmen, und die Hälfte aller einheimischen Fische ist laut der Forest and Bird-Organisation als bedrohte Arten eingestuft. Die Gesundheit dieser Gewässer und ihrer Ökosysteme wird durch die Entwässerung natürlicher Feuchtgebiete beeinträchtigt, die als Filter für Süßwasserkörper dienen. Die Organisation Forest and Bird schätzt, dass 90 Prozent der Feuchtgebiete in New Zealands für die Gestaltung und Entwicklung trockengelegt wurden.
Klimawandel
Als Inselstaat sind die neuseeländischen Ökosysteme auch vom Anstieg des Meeresspiegels bedroht, der durch den vom Menschen verursachten globalen Klimawandel verursacht wird. Das neuseeländische Umweltministerium geht davon aus, dass der projizierte Anstieg des Meeresspiegels unter anderem zu einer verstärkten Küstenerosion und einem stärkeren Eindringen von Meerwasser in Brackmündungen führen wird. Solche Veränderungen bedrohen Ökosysteme der Dünen- und Ufergemeinden, die durch Erosion verloren gehen können, und Ökosysteme der Flussmündung, die den Salzgehalt von reinem Meerwasser nicht vertragen.
Reduktion der Biodiversität
Die Vielfalt und Gesundheit von Pflanzen und Tieren tragen zur Definition eines starken Ökosystems bei und werden allgemein als Biodiversität bezeichnet. In Neuseeland haben die Jagd und die Zerstörung von Lebensräumen zu dem geführt, was das Umweltministerium als "ernsthaften Niedergang" ansieht. Beamte schätzen, dass 32 Prozent der einheimischen Land- und Süßwasservögel in Neuseeland ausgestorben sind und weitere 800 Arten von Tieren, Pflanzen und Pilzen als bedroht gelten.