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Im 19. Jahrhundert war die Taxonomie - die Klassifizierung lebender Organismen - der letzte Schrei in der Biologie. Sowohl Amateure als auch professionelle Naturforscher waren so verrückt danach, Kreaturen zu sammeln und zu identifizieren, dass seltene Käfer ein heißes Gut waren. Zu der Zeit war wenig über Mikroorganismen und ihren Platz in der Welt der Lebewesen bekannt, und die Klassifizierung der Mikrobiologie erhielt nicht so viel Aufmerksamkeit. In den vergangenen Jahrzehnten haben die Kenntnisse über Mikroben und die Methoden zur Identifizierung von Mikroorganismen dramatisch zugenommen, wobei ein Teil dieser Zunahme auf die effiziente Klassifizierung von Mikroorganismen zurückzuführen ist.
Komponenten der Taxonomie
Taxonomie besteht aus drei Komponenten: Nomenklatur, Klassifikation und Identifikation. Die Nomenklatur weist einer Art einfach einen Namen zu. Bei der Klassifizierung werden Arten nach gemeinsamen Merkmalen zusammengefasst, von denen einige physikalisch und einige biochemisch sind. Die Identifizierung verwendet Merkmale eines Organismus, um zu bestimmen, wo er in ein Klassifizierungsschema gehört. Das moderne taxonomische System hat als größte und umfassendste Gruppe die Domänen. Die kleinste Gruppe ist die Art. Von den umfassendsten bis hin zu den spezifischsten Ebenen lauten die folgenden: Domäne, Königreich, Stamm, Klasse, Ordnung, Familie, Gattung und Spezies. Sie sind zum Beispiel Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primas Hominidae Homo sapiens.
Mikroorganismen und Domänen
Mikroorganismen sind äußerst vielfältig. Sie sind nicht durch eine bestimmte Art von Struktur oder Funktion definiert, sondern lediglich durch ihre Größe. Mikroorganismen sind so vielfältig, dass sie in alle drei Hauptkategorien fallen - alle drei Domänen. Eine Domäne ist Bakterien, die andere ist Archaea und die letzte ist Eukarya. Alle Mitglieder der Bakterien- und Archaea-Domänen sind einzellige Mikroorganismen. Sie sind beide Zellen ohne Membranen, die ihr genetisches Material vom Rest der Zellmembranen trennen, die einen Kern definieren. Alle Königreiche, Phyla, Klassen, Ordnungen, Familien, Gattungen und Arten in den Domänen der Bakterien und Archaeen sind also Mikroorganismen.
Einzellige Protisten
Eukarya sind Organismen, deren Zellen einen Kern enthalten. Viele eukaryotische Organismen sind einzellige Mikroorganismen, aber viele andere - wie Redwood-Bäume oder Sie - sind es nicht. Daher sind zusätzliche Klassifizierungen erforderlich. Das Königreich Protista innerhalb der Domäne Eukarya besteht nur aus einzelligen Mikroorganismen. Die Protisten sind in drei verschiedene Gruppen von Phyla unterteilt: vier verschiedene Algenphyla, vier verschiedene Protozoenphyla und zwei verschiedene Schimmelpilzphyla. Aber alle Organismen innerhalb dieser Phyla - alle innerhalb des Königreichs Protista - sind Mikroorganismen.
Mikroskopische Pilze
Das Königreich Pilze ist in der Domäne Eukarya enthalten. Einige der Phyla in den Pilzen enthalten Mikroorganismen. Zum Beispiel enthält das Phylum Zygomycota mikroskopische Brotformen und das Phylum Ascomycota Hefen sowie mikrobielle Pflanzenschädlinge und Parasiten. Flechten sind eine symbiotische Ansammlung eines Pilzes und eines photosynthetischen Organismus - teilweise innerhalb des Königreichs Pilze und teilweise in anderen Reichen oder sogar in anderen Domänen enthalten.